Le jaguar noir n’est pas une sous-espèce de jaguar, il n'est non plus pas très rare d'en trouvé dans les portées. Sa couleur est due à une anomalie génétique dominante appelée mélanisme. Dans la nature ce jaguar est avantagé car il est moins visible, et donc son pelage sert très bien de camouflage aux yeux de ses proies mais aussi de ses prédateurs. On le rencontre plus souvent en milieu forestier qu’en plaine.
Le jaguar noir peut naître dans une portée de jaguars à côté de ses frères tachetés.